Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox11Q7M6Y2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox11Q7M6Y2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Sox11Q7M6Y2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox11Q7M6Y2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox11Q7M6Y2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox11Q7M6Y2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms