Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TwistnbQ78WZ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TwistnbQ78WZ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TwistnbQ78WZ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TwistnbQ78WZ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TwistnbQ78WZ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms