Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SynmQ70IV5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SynmQ70IV5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SynmQ70IV5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SynmQ70IV5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SynmQ70IV5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SynmQ70IV5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SynmQ70IV5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SynmQ70IV5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SynmQ70IV5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SynmQ70IV5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SynmQ70IV5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SynmQ70IV5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SynmQ70IV5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SynmQ70IV5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SynmQ70IV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SynmQ70IV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SynmQ70IV5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SynmQ70IV5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SynmQ70IV5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SynmQ70IV5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SynmQ70IV5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SynmQ70IV5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SynmQ70IV5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SynmQ70IV5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SynmQ70IV5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms