Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ube2oQ6ZPJ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube2oQ6ZPJ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ube2oQ6ZPJ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ube2oQ6ZPJ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2oQ6ZPJ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ube2oQ6ZPJ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms