Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc44a1Q6X893 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc44a1Q6X893 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc44a1Q6X893 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc44a1Q6X893 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc44a1Q6X893 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc44a1Q6X893 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc44a1Q6X893 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slc44a1Q6X893 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc44a1Q6X893 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc44a1Q6X893 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc44a1Q6X893 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc44a1Q6X893 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms