Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd300ld3Q6SJQ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd300ld3Q6SJQ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd300ld3Q6SJQ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd300ld3Q6SJQ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms