Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pabpc4Q6PHQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pabpc4Q6PHQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pabpc4Q6PHQ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pabpc4Q6PHQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pabpc4Q6PHQ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pabpc4Q6PHQ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms