Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrn2Q6PHP6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrn2Q6PHP6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn2Q6PHP6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrn2Q6PHP6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrn2Q6PHP6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lrrn2Q6PHP6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrn2Q6PHP6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrn2Q6PHP6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms