Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc82Q6PG04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc82Q6PG04 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc82Q6PG04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc82Q6PG04 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc82Q6PG04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc82Q6PG04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc82Q6PG04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms