Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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