Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prrt3Q6PE13 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrt3Q6PE13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrt3Q6PE13 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prrt3Q6PE13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prrt3Q6PE13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Prrt3Q6PE13 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms