Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1cQ6PDZ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1cQ6PDZ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1cQ6PDZ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1cQ6PDZ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1cQ6PDZ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf1cQ6PDZ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf1cQ6PDZ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1cQ6PDZ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms