Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85bQ6PDY0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85bQ6PDY0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85bQ6PDY0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85bQ6PDY0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85bQ6PDY0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc85bQ6PDY0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms