Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rundc3bQ6PDC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3bQ6PDC0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc3bQ6PDC0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3bQ6PDC0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc3bQ6PDC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3bQ6PDC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms