Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rexo4Q6PAQ4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo4Q6PAQ4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo4Q6PAQ4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo4Q6PAQ4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo4Q6PAQ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms