Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trak2Q6P9N8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trak2Q6P9N8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trak2Q6P9N8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trak2Q6P9N8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trak2Q6P9N8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak2Q6P9N8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms