Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rtl3Q6P1Y1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl3Q6P1Y1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl3Q6P1Y1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl3Q6P1Y1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtl3Q6P1Y1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtl3Q6P1Y1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms