Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zmiz1Q6P1E1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zmiz1Q6P1E1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zmiz1Q6P1E1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zmiz1Q6P1E1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zmiz1Q6P1E1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zmiz1Q6P1E1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zmiz1Q6P1E1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zmiz1Q6P1E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zmiz1Q6P1E1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zmiz1Q6P1E1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zmiz1Q6P1E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms