Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SphkapQ6NSW3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SphkapQ6NSW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SphkapQ6NSW3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SphkapQ6NSW3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SphkapQ6NSW3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SphkapQ6NSW3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SphkapQ6NSW3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SphkapQ6NSW3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms