Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn11Q6J756 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Capn11Q6J756 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn11Q6J756 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn11Q6J756 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn11Q6J756 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn11Q6J756 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms