Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CltbQ6IRU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CltbQ6IRU5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CltbQ6IRU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltbQ6IRU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms