Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cdk13Q69ZA1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cdk13Q69ZA1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cdk13Q69ZA1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cdk13Q69ZA1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cdk13Q69ZA1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdk13Q69ZA1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk13Q69ZA1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms