Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE6

Ripor1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripor1Q68FE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripor1Q68FE6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripor1Q68FE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripor1Q68FE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ripor1Q68FE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripor1Q68FE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripor1Q68FE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ripor1Q68FE6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ripor1Q68FE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ripor1Q68FE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ripor1Q68FE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripor1Q68FE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripor1Q68FE6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.6 ms