Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4eQ66X19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4eQ66X19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4eQ66X19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4eQ66X19 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4eQ66X19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrp4eQ66X19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4eQ66X19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4eQ66X19 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4eQ66X19 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4eQ66X19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4eQ66X19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4eQ66X19 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms