Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgfr1opQ66JX5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr1opQ66JX5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgfr1opQ66JX5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgfr1opQ66JX5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr1opQ66JX5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgfr1opQ66JX5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms