Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc8eQ66JT1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc8eQ66JT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc8eQ66JT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc8eQ66JT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms