Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcg1Q64343 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcg1Q64343 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcg1Q64343 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcg1Q64343 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcg1Q64343 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcg1Q64343 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms