Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npdc1Q64322 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Npdc1Q64322 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npdc1Q64322 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npdc1Q64322 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Npdc1Q64322 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms