Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nup62Q63850 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup62Q63850 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nup62Q63850 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nup62Q63850 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup62Q63850 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms