Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms