Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Supt6hQ62383 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Supt6hQ62383 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Supt6hQ62383 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Supt6hQ62383 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Supt6hQ62383 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Supt6hQ62383 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Supt6hQ62383 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Supt6hQ62383 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Supt6hQ62383 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms