Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpcQ62241 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpcQ62241 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SnrpcQ62241 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms