Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbm38Q62176 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbm38Q62176 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbm38Q62176 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbm38Q62176 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbm38Q62176 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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