Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna2Q61301 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna2Q61301 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ctnna2Q61301 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnna2Q61301 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna2Q61301 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms