Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc9a1Q61165 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc9a1Q61165 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc9a1Q61165 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc9a1Q61165 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc9a1Q61165 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slc9a1Q61165 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms