Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prpf4bQ61136 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prpf4bQ61136 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf4bQ61136 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf4bQ61136 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prpf4bQ61136 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prpf4bQ61136 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prpf4bQ61136 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpf4bQ61136 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms