Protein–RNA interactions for Protein: Q60930

Vdac2, Voltage-dependent anion-selective channel protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac2Q60930 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vdac2Q60930 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vdac2Q60930 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vdac2Q60930 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vdac2Q60930 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vdac2Q60930 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vdac2Q60930 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vdac2Q60930 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vdac2Q60930 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vdac2Q60930 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vdac2Q60930 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vdac2Q60930 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms