Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csnk2a1Q60737 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk2a1Q60737 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csnk2a1Q60737 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Csnk2a1Q60737 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk2a1Q60737 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms