Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChukQ60680 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChukQ60680 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChukQ60680 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChukQ60680 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChukQ60680 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChukQ60680 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChukQ60680 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChukQ60680 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChukQ60680 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChukQ60680 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChukQ60680 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChukQ60680 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChukQ60680 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChukQ60680 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChukQ60680 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChukQ60680 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChukQ60680 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChukQ60680 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChukQ60680 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ChukQ60680 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms