Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2aQ60648 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2aQ60648 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2aQ60648 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2aQ60648 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2aQ60648 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2aQ60648 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2aQ60648 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms