Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h2Q60644 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h2Q60644 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h2Q60644 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1h2Q60644 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h2Q60644 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h2Q60644 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms