Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Satb1Q60611 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Satb1Q60611 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Satb1Q60611 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Satb1Q60611 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Satb1Q60611 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms