Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrcc1Q60596 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrcc1Q60596 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc1Q60596 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xrcc1Q60596 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xrcc1Q60596 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xrcc1Q60596 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms