Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Lmtk3Q5XJV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lmtk3Q5XJV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Lmtk3Q5XJV6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lmtk3Q5XJV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmtk3Q5XJV6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmtk3Q5XJV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lmtk3Q5XJV6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lmtk3Q5XJV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lmtk3Q5XJV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Lmtk3Q5XJV6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lmtk3Q5XJV6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Lmtk3Q5XJV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lmtk3Q5XJV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lmtk3Q5XJV6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms