Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lhfpl4Q5U4E0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lhfpl4Q5U4E0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lhfpl4Q5U4E0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lhfpl4Q5U4E0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lhfpl4Q5U4E0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lhfpl4Q5U4E0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms