Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NkaplQ5SZT7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NkaplQ5SZT7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NkaplQ5SZT7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NkaplQ5SZT7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NkaplQ5SZT7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NkaplQ5SZT7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms