Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim38Q5SZ99 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim38Q5SZ99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim38Q5SZ99 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim38Q5SZ99 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim38Q5SZ99 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim38Q5SZ99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim38Q5SZ99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim38Q5SZ99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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