Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW28

Pik3r5, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r5Q5SW28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pik3r5Q5SW28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pik3r5Q5SW28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pik3r5Q5SW28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pik3r5Q5SW28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pik3r5Q5SW28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pik3r5Q5SW28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pik3r5Q5SW28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms