Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms