Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SynrgQ5SV85 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SynrgQ5SV85 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SynrgQ5SV85 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SynrgQ5SV85 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynrgQ5SV85 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SynrgQ5SV85 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynrgQ5SV85 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynrgQ5SV85 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms